侦查系成立于1982年，1998年与南京大学联合办学设置侦查学本科专业，2002年设置侦查学专业，2009年设置经济犯罪侦查专业。侦查系设有刑事侦查学、经济犯罪侦查学、国家安全学、犯罪学4个教研室和刑事侦查综合实验室、侦查学研究所。专业教学和科学研究涉及刑事侦查学、经济犯罪侦查学、国家安全学、刑事法学、犯罪学等多个专业领域和研究方向。

侦查系现有干部教师33人，其中教授4人，副教授11人，另有10余位兼职教师和20余位公安机关实战兼职教官。博士学位教师17人，80%以上的教师具有硕士以上学位。有全国优秀人民警察2人，全国公安高等教育部级教学名师1人，省“青蓝工程”中青年学术带头人2人，省“333高层次人才培养工程”第三层次培养对象1人，省“六大人才高峰”高层次人才1人，省“青蓝工程”优秀青年骨干教师3人，全省公安机关优秀教师3人、院教学名师3人。侦查学教学团队、经济犯罪侦查学教学团队2020年、2021年分别被评为江苏高校“青蓝工程”优秀教学团队，“涉网新型犯罪治理”团队同时获批学院第三轮“五个一批”省级培育教学和科研团队，建有“社会治理与犯罪控制研究”科研创新团队、大数据侦查、经侦数据化实战教学团队、侦查能力提升教官团队等。

国家安全学2022年获批省“十四五”重点学科，诉讼法学2008年获批省重点建设学科，侦查学列入江苏省优势学科公安学的主要研究方向。侦查学专业先后获批省特色专业、省重点专业、省品牌专业建设工程一期项目（A类专业）、省一流本科专业，2020年获批国家级一流本科专业，2023年获批省级产教融合型品牌专业建设点；经济犯罪侦查专业先后获批省重点专业、教育部教育教学改革试点项目，2020年获批省高校一流本科专业，2021年获批省首批课程思政示范专业。《经济犯罪侦查总论》《金融犯罪案件侦查》获批国家级一流本科课程，《侦查学》《讯问学》等4门课程获批省级一流本科课程、省一类优秀课程，《侦查学原理》《犯罪现场勘查学》获批省二类精品课程。《经济犯罪侦查》《讯问学》获批省高校重点教材，《犯罪现场勘查学》《警察法学原理》获批省本科优秀教材，2门教材分别获批省“十四五”普通高等教育本科省级规划教材、省高校精品教材。刑事侦查实验室被确定为省实验教学示范中心建设点，2020年成功申报“江苏省微表情智能感知与安全防控工程研究中心”。